RNA–Protein interactions for RNA: YNR001C

CIT1, Transcript of Citrate synthase, yeast

Gene CIT1, Length 1,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIT1	YNR001C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	CHD1	P32657	1468 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	RAD2	P07276	1031 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	RAD4	P14736	754 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	YEN1	P40028	759 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	MMM1	P41800	426 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	MON1	P53129	644 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	KAR1	P11927	433 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	SRM1	P21827	482 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	THI4	P32318	326 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	MRPS18	P42847	217 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CIT1	YNR001C	PRI2	P20457	528 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	UBP12	P39538	1254 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	CIT3	P43635	486 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	ALT1	P52893	592 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	PMT7	Q06644	662 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	TIM23	P32897	222 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	EXO5	P38289	585 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YGR045C	P53229	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	RNQ1	P25367	405 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	SFP1	P32432	683 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	UGA4	P32837	571 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	SEG2	P34250	1132 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	NIT1	P40447	199 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	SLS1	P42900	643 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	RCM1	P53972	490 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	TOS4	Q06266	489 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	SPO75	Q07798	868 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	MCD1	Q12158	566 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	DPB3	P27344	201 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	NEM1	P38757	446 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	DAL4	Q04895	635 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	OPI10	Q08202	246 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	UFD4	P33202	1483 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
CIT1	YNR001C	SEC6	P32844	805 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	FLC1	Q08967	793 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	CDC34	P14682	295 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	GAL11	P19659	1081 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	MRC1	P25588	1096 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	TYW3	P53177	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	FOL1	P53848	824 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	DNM1	P54861	757 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YVC1	Q12324	675 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	DFG16	Q99234	619 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	SIN3	P22579	1536 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	ADR1	P07248	1323 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YCR015C	P25616	317 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	HSP78	P33416	811 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	TAT2	P38967	592 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	FAA3	P39002	694 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	PEX7	P39108	375 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	ECL1	P48235	211 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CIT1	YNR001C	NFS1	P25374	497 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	YGR053C	P53234	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	PPM2	Q08282	695 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CIT1	YNR001C	BAS1	P22035	811 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.4 ms