RNA–Protein interactions for RNA: YML057W

CMP2, Transcript of Calcineurin A, yeast

Gene CMP2, Length 1,815 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMP2	YML057W	FZO1	P38297	855 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	CTM1	P38818	585 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.52	□□□□□ -0.73	not detected
CMP2	YML057W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	YDR306C	Q06640	478 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	ISW2	Q08773	1120 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	HIF1	Q12373	385 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	RSF2	P46974	1380 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	VPH2	P32341	215 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	CBF2	P32504	956 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	NPL6	P32832	435 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	STB1	P42845	420 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	TAF1	P46677	1066 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	MDR1	P53258	950 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	NSE3	Q05541	303 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SLX4	Q12098	748 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SPO11	P23179	398 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SCJ1	P25303	377 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	YCR051W	P25631	222 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	YJR039W	P47107	1121 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	UFD2	P54860	961 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	YKR005C	Q02203	525 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	BDF2	Q07442	638 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	RGP1	P16664	663 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	CPS1	P27614	576 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	RIB7	P33312	244 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SYG1	P40528	902 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	VTC2	P43585	828 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	ECM23	Q02710	187 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	AFT2	Q08957	416 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SHC1	P39000	512 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	FMP30	Q02883	468 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	HFD1	Q04458	532 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	YPR097W	Q06839	1073 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	ALR1	Q08269	859 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	MSH5	Q12175	901 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SIN4	P32259	974 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	YET1	P35723	206 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	FAP1	P53971	965 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	PET122	P10355	254 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	BRO1	P48582	844 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	COG6	P53959	839 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	YLR287C	Q05881	355 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	OSW1	Q08692	278 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SPO12	P17123	173 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	CSE1	P33307	960 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	DSL1	P53847	754 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	PIG1	Q06216	648 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	ATG17	Q06410	417 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SNA3	P14359	133 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	PEP3	P27801	918 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	FMS1	P50264	508 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	TAF9	Q05027	157 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	VIK1	Q12045	647 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CMP2	YML057W	SFB2	P53953	876 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	NCA2	Q12374	616 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	CBP3	P21560	335 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	DIT2	P21595	489 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	REC107	P21651	314 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	HXT1	P32465	570 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	PTH2	P34222	208 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CMP2	YML057W	SIP3	P38717	1229 aa		10.45	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.1 ms