RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W GCR1P07261 785 aa7.04□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W GAS1P22146 559 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W GNP1P48813 663 aa7.04□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W RSC58Q07979 502 aa7.04□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W KOG1P38873 1557 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W RNQ1P25367 405 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W AIM26P32858 118 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W RGD1P38339 666 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W RTT10Q08924 1013 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W SPO21Q12411 609 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR104WYKR104W SYP1P25623 870 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W BAP2P38084 609 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W HXT13P39924 564 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W UBP5P39944 805 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W HXT17P53631 564 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W HXT15P54854 567 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data7.01□□□□□ -1.29not detected
YKR104WYKR104W PAM1P37304 830 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W PIK1P39104 1066 aa7.01□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W GPB2P39717 880 aa7.01□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W CNN1P43618 361 aa7.01□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W SPS1P08458 490 aa7□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W DBP5P20449 482 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W RSB1Q08417 382 aa7□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W TSA1P34760 196 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W CDA2Q06703 312 aa6.99□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W HNT2P49775 206 aa6.98□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W SNO2P53823 222 aa6.98□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W MRPL22P53881 309 aa6.98□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W PET112P33893 541 aa6.97□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W MNR2P35724 969 aa6.97□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
YKR104WYKR104W SNF5P18480 905 aa6.96□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W RER2P35196 286 aa6.96□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W ETP1P38748 585 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W SEC26P41810 973 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W YDL177CQ12257 170 aa6.96□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W MLS1P30952 554 aa6.95□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W YTA7P40340 1379 aa6.95□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W YOR352WQ08816 343 aa6.94□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W CDC34P14682 295 aa6.93□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W BRN1P38170 754 aa6.93□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W MPH1P40562 993 aa6.93□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W GNT1Q12096 491 aa6.93□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W YER152CP10356 443 aa6.92□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W RIM8P53179 542 aa6.92□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W LYP1P32487 611 aa6.91□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W MCM7P38132 845 aa6.91□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W AIM3P38266 947 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
YKR104WYKR104W SOD2P00447 233 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W DUT1P33317 147 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W RFC5P38251 354 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W SVF1Q05515 481 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W TRP2P00899 507 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W TOP1P04786 769 aa6.88□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W SNF7P39929 240 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W KRI1P42846 591 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W RSM24Q03976 319 aa6.88□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W THS1P04801 734 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W CLN2P20438 545 aa6.87□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W THI80P35202 319 aa6.87□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W TYW3P53177 273 aa6.87□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data6.87□□□□□ -1.31not detected
YKR104WYKR104W SPO20Q04359 397 aa6.87□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W SGD1Q06132 899 aa6.87□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W ATG13Q06628 738 aa6.87□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W RKM4Q12504 494 aa6.87□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W RPS13P05756 151 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W BAS1P22035 811 aa6.86□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W GEM1P39722 662 aa6.86□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W EEB1Q02891 456 aa6.86□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W ACM1Q08981 209 aa6.86□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W SVS1Q12254 260 aa6.86□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W ESC8Q08119 714 aa6.85□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W YPL277CQ08989 487 aa6.85□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W INO1P11986 533 aa6.84□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W YFL054CP43549 646 aa6.84□□□□□ -1.31
YKR104WYKR104W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W UGA2P38067 497 aa6.83□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W LAM1P38851 1228 aa6.83□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W RRT14P40470 206 aa6.83□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W YGR053CP53234 283 aa6.83□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W TOD6P34219 525 aa6.82□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W YKL107WP34251 309 aa6.82□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W PNT1P38969 423 aa6.82□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W MXR1P40029 184 aa6.82□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W YCR015CP25616 317 aa6.81□□□□□ -1.32
YKR104WYKR104W OCA5P38738 679 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 61.7 ms