RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data5.18□□□□□ -1.58not detected
PIR3YKL163W YJR107WP47145 328 aa5.18□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W SDH1Q00711 640 aa5.18□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W GIC2Q06648 383 aa5.18□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W ATG1P53104 897 aa5.17□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W MDG1P53885 366 aa5.17□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data5.17□□□□□ -1.58not detected
PIR3YKL163W MNL2Q12205 849 aa5.17□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W WHI5Q12416 295 aa5.17□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W YOR131CQ12486 218 aa5.17□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W CIT2P08679 460 aa5.16□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data5.16□□□□□ -1.58not detected
PIR3YKL163W ACF4P47129 309 aa5.16□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W UFD2P54860 961 aa5.16□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W YGR161W-CQ3E744 92 aa5.16□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W CLN2P20438 545 aa5.15□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W NPR1P22211 790 aa5.15□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W GPT2P36148 743 aa5.15□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W RIM11P38615 370 aa5.15□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W YNL011CP53980 444 aa5.15□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W TRS120Q04183 1289 aa5.15□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W ALD6P54115 500 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W RPN4Q03465 531 aa5.14□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W NSE3Q05541 303 aa5.14□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W YOR223WQ12015 292 aa5.14□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W ECM2P38241 364 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W IOC3P43596 787 aa5.13□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W LRG1P35688 1017 aa5.12□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W RMD1Q03441 430 aa5.12□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W YOL057WQ08225 711 aa5.12□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W MET6P05694 767 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W HTS1P07263 546 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W GRX4P32642 244 aa5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W UGA2P38067 497 aa5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W GRX7P38068 203 aa5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W YHL008CP38750 627 aa5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W BSC2Q05611 235 aa5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W NUT2Q06213 157 aa5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W GPI13Q07830 1017 aa5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W PIN2Q12057 282 aa5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W FLP1P03870 423 aa5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W KAR1P11927 433 aa5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W RNQ1P25367 405 aa5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W MNN1P39106 762 aa5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W MMM1P41800 426 aa5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W CDC55Q00362 526 aa5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W VPS16Q03308 798 aa5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W AOS1Q06624 347 aa5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W FRT1Q99332 602 aa5.1□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W MET4P32389 672 aa5.09□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W ELM1P32801 640 aa5.09□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W SEG2P34250 1132 aa5.09□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W RPN11P43588 306 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W TY4A-JP47023 414 aa5.09□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W MSH6Q03834 1242 aa5.09□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W YIG1Q08956 461 aa5.09□□□□□ -1.59
PIR3YKL163W DPB3P27344 201 aa5.08□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W POL12P38121 705 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W BUD6P41697 788 aa5.08□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W CIT3P43635 486 aa5.08□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W GCV1P48015 400 aa5.08□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W NUT1P53114 1132 aa5.08□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W YDL121CQ07541 149 aa5.08□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W INP54Q08227 384 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W GCN2P15442 1659 aa5.08□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W PEP7P32609 515 aa5.07□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W MFT1P33441 392 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W TAF5P38129 798 aa5.07□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data5.07□□□□□ -1.6not detected
PIR3YKL163W MON1P53129 644 aa5.07□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W CWC24P53769 259 aa5.07□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W RCM1P53972 490 aa5.07□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W YLL054CQ12244 843 aa5.07□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W RAD9P14737 1309 aa5.06□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W REI1P38344 393 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W ERP2P39704 215 aa5.06□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W FYV10P40492 516 aa5.06□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W SAP155P43612 1002 aa5.06□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W MEC3Q02574 474 aa5.06□□□□□ -1.6
PIR3YKL163W EAR1Q03212 550 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.2 ms