RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	ATG26	Q06321	1198 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	HMI1	Q12039	706 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	YRM1	Q12340	786 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	DRS2	P39524	1355 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	ATG2	P53855	1592 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	BUD14	P27637	709 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	PUP2	P32379	260 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	PBY1	P38254	753 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	GYP7	P48365	746 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	VTC3	Q02725	835 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	PCL8	Q08966	492 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	APC2	Q12440	853 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	MRPS28	P21771	286 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.53	□□□□□ -1.84	not detected
DOA4	YDR069C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	PMT7	Q06644	662 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DOA4	YDR069C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MCM2	P29469	868 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ALG14	P38242	237 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	NUT1	P53114	1132 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	HIR3	P47171	1648 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MRP10	O75012	95 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MET1	P36150	593 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SDS3	P40505	327 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	NEO1	P40527	1151 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YJR107W	P47145	328 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YGL140C	P53120	1219 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	TPO2	P53283	614 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	DNM1	P54861	757 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YMR102C	Q03177	834 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YDR338C	Q05497	695 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PSR1	Q07800	427 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	GLO4	Q12320	285 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	NUP145	P49687	1317 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	HMG1	P12683	1054 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	DAL5	P15365	543 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	BLI1	P35727	113 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	TAF1	P46677	1066 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PKH1	Q03407	766 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	UBX2	Q04228	584 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	HSP42	Q12329	375 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PET123	P17558	318 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MRC1	P25588	1096 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	TRK2	P28584	889 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SHC1	P39000	512 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	GUP1	P53154	560 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.51	□□□□□ -1.85	not detected
DOA4	YDR069C	YPL062W	Q02781	134 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MSH6	Q03834	1242 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SLP1	Q12232	587 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SFI1	Q12369	946 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	GDB1	Q06625	1536 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	AI1	P03875	834 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	COY1	P34237	679 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SQT1	P35184	431 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ATG14	P38270	344 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	HSM3	P38348	480 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	FET4	P40988	552 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	MRPS18	P42847	217 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	RSM26	P47141	266 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	BTN2	P53286	410 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	YNR014W	P53719	212 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SOG2	Q08817	791 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	COB	P00163	385 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	NPR1	P22211	790 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	STE5	P32917	917 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	SHU2	P38957	223 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DOA4	YDR069C	VPS41	P38959	992 aa		3.5	□□□□□ -1.85

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