RNA–Protein interactions for RNA: YDR057W

YOS9, Transcript of ER quality-control lectin, yeast

Gene YOS9, Length 1,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOS9	YDR057W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	HST1	P53685	503 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	UBX4	P54730	416 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	ADA2	Q02336	434 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	SND1	Q04007	877 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	ESC8	Q08119	714 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	NYV1	Q12255	253 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	YOR131C	Q12486	218 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	ENT1	Q12518	454 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	NTG1	P31378	399 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	RIB7	P33312	244 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	SPT8	P38915	602 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	YIL166C	P40445	542 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	BNA1	P47096	177 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	YGR153W	P48238	217 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	YNL144C	P53907	740 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	YOL087C	Q99247	1116 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	SEN2	P16658	377 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	HIR1	P32479	840 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	RIM11	P38615	370 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	ERP5	P38819	212 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	YHR131C	P38835	850 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	PET100	P38958	111 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	MET18	P40469	1032 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	AGX1	P43567	385 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	ALG2	P43636	503 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	IML2	P47031	731 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	NSE5	Q03718	556 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	LAP2	Q10740	671 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	BUD2	P33314	1104 aa		7.34	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	YEL1	P34225	687 aa		7.34	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	GAD1	Q04792	585 aa		7.34	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	YPR204W	Q08995	1032 aa		7.34	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	REC8	Q12188	680 aa		7.34	□□□□□ -1.23
YOS9	YDR057W	SRM1	P21827	482 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	MCM2	P29469	868 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	SFA1	P32771	386 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	SGS1	P35187	1447 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	MIA40	P36046	403 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	MRPL40	P36534	297 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	TOK1	P40310	691 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	RRN7	P40992	514 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	SEC5	P89102	971 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	YMR018W	Q04364	514 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	TAF3	Q12297	353 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	OSH2	Q12451	1283 aa		7.34	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	ITR1	P30605	584 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	IMP2'	P32351	346 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	TFB1	P32776	642 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	CNS1	P33313	385 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	YHL050C	P38721	697 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	SHC1	P39000	512 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	HUL4	P40985	892 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	APL6	P46682	809 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	FPK1	P53739	893 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.33	□□□□□ -1.24	not detected
YOS9	YDR057W	CIR2	Q08822	631 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	YPL277C	Q08989	487 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	MED1	Q12321	566 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	SMC6	Q12749	1114 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	KSS1	P14681	368 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	AMS1	P22855	1083 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	NUF2	P33895	451 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	TMN3	P40071	706 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	YIR042C	P40586	236 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	IAH1	P41734	238 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	NUP84	P52891	726 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	FDC1	Q03034	503 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	VPS16	Q03308	798 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	ARP9	Q05123	467 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	PPM2	Q08282	695 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	KRE6	P32486	720 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	PIH1	P38768	344 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	PCL7	P40186	285 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	NUP82	P40368	713 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YOS9	YDR057W	SUM1	P46676	1062 aa		7.31	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.4 ms