RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W PFD1P46988 109 aa6.2□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W THI72Q08579 599 aa6.2□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W POL1P13382 1468 aa6.2□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W RET1P22276 1149 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W MLS1P30952 554 aa6.2□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W YKL107WP34251 309 aa6.2□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W NNK1P36003 928 aa6.2□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W YGL176CP46945 554 aa6.2□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W TIM54P47045 478 aa6.2□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W SMY2P32909 740 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W GPT2P36148 743 aa6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W MCM7P38132 845 aa6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data6.19□□□□□ -1.42not detected
PRD1YCL057W PBY1P38254 753 aa6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W FMP25Q08023 583 aa6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W GNT1Q12096 491 aa6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W SPO75Q07798 868 aa6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W YPL260WQ08977 551 aa6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W YOR131CQ12486 218 aa6.19□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W SNF7P39929 240 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W SIP5P40210 489 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W ALT1P52893 592 aa6.18□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W FLC1Q08967 793 aa6.18□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W SBP1P10080 294 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W KIP1P28742 1111 aa6.17□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W OSW7P43611 510 aa6.17□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W RNH70P53331 553 aa6.17□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W SCC2Q04002 1493 aa6.17□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W RSC6P25632 483 aa6.17□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W MDJ1P35191 511 aa6.17□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W ARI1P53111 347 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W NFS1P25374 497 aa6.16□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W MBP1P39678 833 aa6.16□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W UTP8P53276 713 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W DOS2P54858 310 aa6.16□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W YDR215CQ12240 137 aa6.16□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W YER152CP10356 443 aa6.16□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W PRY1P47032 299 aa6.16□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W NSG2P53898 299 aa6.16□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W YCK2P23292 546 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W RSP5P39940 809 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W PNT1P38969 423 aa6.14□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W ERP6P53198 216 aa6.14□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W YGR125WP53273 1036 aa6.14□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W SPO21Q12411 609 aa6.14□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W OSH2Q12451 1283 aa6.14□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W RPN3P40016 523 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W GIC2Q06648 383 aa6.14□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W CIT1P00890 479 aa6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W HSP60P19882 572 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W RRP14P36080 434 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W YJL045WP47052 634 aa6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W EAF1Q06337 982 aa6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W EAR1Q03212 550 aa6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W SSM4P40318 1319 aa6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W SPP41P38904 1435 aa6.13□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W PRP9P19736 530 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W DBP2P24783 546 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W GPB2P39717 880 aa6.12□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W ALG12P53730 551 aa6.12□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W YMR187CQ03236 431 aa6.12□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W TAF8Q03750 510 aa6.12□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W CAN1P04817 590 aa6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W SPC42P36094 363 aa6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W GGA2P38817 585 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W NMD3P38861 518 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W NUP82P40368 713 aa6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W YSC84P32793 468 aa6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W TIM23P32897 222 aa6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W PGM1P33401 570 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W BAP2P38084 609 aa6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W SKN7P38889 622 aa6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W TPP1Q03796 238 aa6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W PHM7Q12252 991 aa6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W RKR1Q04781 1562 aa6.11□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W HBS1P32769 611 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W PPG1P32838 368 aa6.1□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data6.1□□□□□ -1.43not detected
PRD1YCL057W YPK9Q12697 1472 aa6.1□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W ARE1P25628 610 aa6.1□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W BRN1P38170 754 aa6.1□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W MXR1P40029 184 aa6.1□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W ALR2P43553 858 aa6.1□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W UBX5Q06682 500 aa6.1□□□□□ -1.43
PRD1YCL057W YPR053CQ6Q5F3 151 aa6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms