RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555017.5

SEC23A-208, Transcript of Sec23 homolog A, coat complex II component, human

TSL 4

Gene SEC23A, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEC23A-208	ENST00000555017	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	RELB	Q01201	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017		Q6ZVU0	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SEC23A-208	ENST00000555017	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	ATP10B	O94823	1461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	ABCC2	Q92887	1545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	BMP2	P12643	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	KIF14	Q15058	1648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017		A6NJR5	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	TRAK2	O60296	914 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	VEGFB	P49765	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	TRIM47	Q96LD4	638 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	ADH1A	P07327	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	PTGIR	P43119	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	GLMN	Q92990	594 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017		A0A1W2PRU2	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	SPINT1	O43278	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	SKI	P12755	728 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	SCARF1	Q14162	830 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	RNF20	Q5VTR2	975 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	TSPOAP1	O95153	1857 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	NCOA2	Q15596	1464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	MEN1	O00255	615 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	IL2RA	P01589	272 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	ITGAE	P38570	1179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	NCOA4	Q13772	614 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SEC23A-208	ENST00000555017	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SEC23A-208	ENST00000555017	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC23A-208	ENST00000555017	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC23A-208	ENST00000555017	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC23A-208	ENST00000555017	RHOQ	P17081	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC23A-208	ENST00000555017	SOX11	P35716	441 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC23A-208	ENST00000555017	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC23A-208	ENST00000555017	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC23A-208	ENST00000555017	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SEC23A-208	ENST00000555017	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SEC23A-208	ENST00000555017	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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