RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-204ENST00000504936 CASZ1Q86V15 1759 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 ANP32CO43423 234 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 ZNF827Q17R98 1081 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 ATG3Q9NT62 314 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 MRC1P22897 1456 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 C4BP0C0L5 1744 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.23■■□□□ 1.63
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PITX1-204ENST00000504936 TEFQ10587 303 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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PITX1-204ENST00000504936 LRP5O75197 1615 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-204ENST00000504936 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.22■■□□□ 1.63
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PITX1-204ENST00000504936 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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PITX1-204ENST00000504936 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.18■■□□□ 1.62
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PITX1-204ENST00000504936 IL17REQ8NFR9 667 aa25.15■■□□□ 1.62
PITX1-204ENST00000504936 ITPK1Q13572 414 aa25.14■■□□□ 1.62
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PITX1-204ENST00000504936 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.14■■□□□ 1.62
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PITX1-204ENST00000504936 DCTN1Q14203 1278 aa25.13■■□□□ 1.61
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PITX1-204ENST00000504936 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PITX1-204ENST00000504936 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PITX1-204ENST00000504936 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.1■■□□□ 1.61
PITX1-204ENST00000504936 GNPATO15228 680 aa25.1■■□□□ 1.61
PITX1-204ENST00000504936 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.1■■□□□ 1.61
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PITX1-204ENST00000504936 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.09■■□□□ 1.61
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PITX1-204ENST00000504936 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.06■■□□□ 1.6
PITX1-204ENST00000504936 CCDC184Q52MB2 194 aa25.05■■□□□ 1.6
PITX1-204ENST00000504936 ZNF790Q6PG37 636 aa25.05■■□□□ 1.6
PITX1-204ENST00000504936 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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PITX1-204ENST00000504936 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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PITX1-204ENST00000504936 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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PITX1-204ENST00000504936 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PITX1-204ENST00000504936 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX1-204ENST00000504936 C4AP0C0L4 1744 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX1-204ENST00000504936 SSFA2P28290 1259 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX1-204ENST00000504936 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX1-204ENST00000504936 MSL1Q68DK7 614 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX1-204ENST00000504936 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.02■■□□□ 1.6
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PITX1-204ENST00000504936 AMIGO3Q86WK7 504 aa25■■□□□ 1.59
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PITX1-204ENST00000504936 STARD3NLO95772 234 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX1-204ENST00000504936 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX1-204ENST00000504936 KLHL34Q8N239 644 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX1-204ENST00000504936 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PITX1-204ENST00000504936 RPS6KA4O75676 772 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 PTGER2P43116 358 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 APAF1O14727 1248 aa24.94■■□□□ 1.58
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