RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.04□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.04□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.04□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.03□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.03□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 ALDH1A1P00352 501 aa10.03□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 RFC5P40937 340 aa10.03□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 AGERQ15109 404 aa10.03□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.02□□□□□ -0.8
PRPF40A-210ENST00000489741 J3QL48 77 aa10.02□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 MYT1Q01538 1121 aa10.02□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 NBPF14Q5TI25 921 aa10.02□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 NLRP1Q9C000 1473 aa10.02□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.01□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 SMPD1P17405 629 aa10.01□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXJ1Q92949 421 aa10.01□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 MED14O60244 1454 aa10□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 USP17L8P0C7I0 530 aa10□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 SOCS7O14512 581 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 ABCC3O15438 1527 aa9.98□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 ST8SIA5O15466 376 aa9.98□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 SIAH2O43255 324 aa9.98□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 NR6A1Q15406 480 aa9.98□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.98□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.98□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.98□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 ABCC5O15440 1437 aa9.98□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.97□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 TOM1O60784 492 aa9.97□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 AVPP01185 164 aa9.97□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.97□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 ERVK-7P63135 1459 aa9.97□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.97□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PRPF40A-210ENST00000489741 AXIN1O15169 862 aa9.96□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.96□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.96□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 CPS1P31327 1500 aa9.96□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.96□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 LTKP29376 864 aa9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 HSPA1LP34931 641 aa9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 PNMA1Q8ND90 353 aa9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 HPS1Q92902 700 aa9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 AAASQ9NRG9 546 aa9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 KIF15Q9NS87 1388 aa9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 DUOX2Q9NRD8 1548 aa9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.95□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 DEPDC5O75140 1603 aa9.94□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 ARID5BQ14865 1188 aa9.94□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.94□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.94□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 ERBINQ96RT1 1412 aa9.93□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.93□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.93□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.92□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 DAPK1P53355 1430 aa9.92□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.92□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 PIP4K2BP78356 416 aa9.92□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.92□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.92□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 ALKQ9UM73 1620 aa9.92□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 IDI1Q13907 227 aa9.91□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.91□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 MPNDQ8N594 471 aa9.91□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF787Q6DD87 383 aa9.9□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.9□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.9□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.9□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 SLIT1O75093 1534 aa9.9□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.9□□□□□ -0.82
PRPF40A-210ENST00000489741 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.89□□□□□ -0.83
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.89□□□□□ -0.83
PRPF40A-210ENST00000489741 ADH1CP00326 375 aa9.89□□□□□ -0.83
PRPF40A-210ENST00000489741 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.89□□□□□ -0.83
PRPF40A-210ENST00000489741 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRPF40A-210ENST00000489741 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.89□□□□□ -0.83
PRPF40A-210ENST00000489741 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.88□□□□□ -0.83
PRPF40A-210ENST00000489741 PTK2Q05397 1052 aa9.88□□□□□ -0.83
PRPF40A-210ENST00000489741 NNTQ13423 1086 aa9.88□□□□□ -0.83
PRPF40A-210ENST00000489741 ZBTB33Q86T24 672 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms