Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVP2

GNL3, Guanine nucleotide-binding protein-like 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNL3Q9BVP2 CPSF1-205ENST00000531042 580 ntTSL 518.91■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 C17orf99-205ENST00000586999 379 ntTSL 217.22■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 C17orf99-206ENST00000591995 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.78■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 C17orf99-201ENST00000340363 984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 HDGFL3-204ENST00000563790 934 ntTSL 312.7□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 210.6□□□□□ -0.714e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 HDGFL3-206ENST00000568294 3397 ntTSL 410.28□□□□□ -0.764e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 GABRE-207ENST00000476016 813 ntTSL 49.58□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.964e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-220ENST00000487640 566 ntTSL 48.9□□□□□ -0.984e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 HDGFL3-202ENST00000562702 449 ntTSL 58.03□□□□□ -1.124e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.258e-11■■■■■ 35.5
GNL3Q9BVP2 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.025e-56■■■■■ 35.3
GNL3Q9BVP2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 34.3
GNL3Q9BVP2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.523e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.413e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.333e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-210ENST00000519569 2355 ntTSL 222.38■■□□□ 1.173e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-215ENST00000520266 878 ntTSL 322.33■■□□□ 1.173e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-219ENST00000521766 2736 ntTSL 222.26■■□□□ 1.153e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.123e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.943e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-229ENST00000523485 2705 ntTSL 220.26■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-207ENST00000518686 2897 ntTSL 218.61■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-238ENST00000559838 643 ntTSL 315.47■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-236ENST00000559138 2041 ntTSL 1 (best)14.67□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-240ENST00000562292 735 ntTSL 512.94□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-235ENST00000557823 635 ntTSL 312.57□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-217ENST00000521388 770 ntTSL 511.65□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-231ENST00000524120 546 ntTSL 311.06□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC6.59□□□□□ -1.351e-323■■■■■ 33.6
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 318.98■□□□□ 0.631e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.461e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.081e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.922e-8■■■■■ 32.6
GNL3Q9BVP2 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)19.92■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 32.6
GNL3Q9BVP2 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 32.6
GNL3Q9BVP2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.952e-10■■■■■ 31.7
GNL3Q9BVP2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.172e-10■■■■■ 31.7
GNL3Q9BVP2 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 410.52□□□□□ -0.732e-10■■■■■ 31.7
GNL3Q9BVP2 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.114e-13■■■■■ 29.6
GNL3Q9BVP2 ZFHX4-AS1-204ENST00000522961 240 ntTSL 514.13□□□□□ -0.154e-13■■■■■ 29.6
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.585e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.115e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-205ENST00000462715 2428 ntTSL 212.75□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-206ENST00000469757 221 ntTSL 29.89□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.211e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-214ENST00000482865 567 ntTSL 47.37□□□□□ -1.231e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 27.6
GNL3Q9BVP2 CPM-213ENST00000551897 655 ntTSL 512.17□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 27.6
GNL3Q9BVP2 CPM-203ENST00000546556 697 ntTSL 211.26□□□□□ -0.613e-9■■■■■ 27.6
GNL3Q9BVP2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.545e-25■■■■■ 27.4
GNL3Q9BVP2 MSMO1-205ENST00000507013 973 ntTSL 225.63■■□□□ 1.695e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-213ENST00000440349 1509 ntTSL 1 (best)22.25■■□□□ 1.155e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.665e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.175e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-218ENST00000495516 350 ntTSL 515.28■□□□□ 0.045e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-212ENST00000412402 3495 ntTSL 213.6□□□□□ -0.235e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.055e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 MSMO1-204ENST00000505270 482 ntTSL 37.71□□□□□ -1.185e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.365e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.535e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-214ENST00000441290 8301 ntTSL 24□□□□□ -1.775e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.54□□□□□ -21e-323■■■■□ 26.1
GNL3Q9BVP2 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.85□□□□□ -1.794e-8■■■■□ 24.4
GNL3Q9BVP2 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-323■■■■□ 24.2
GNL3Q9BVP2 AKAP6-202ENST00000553547 2274 ntTSL 211.05□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 22.7
GNL3Q9BVP2 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.161e-6■■■■□ 22.7
GNL3Q9BVP2 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 22.7
GNL3Q9BVP2 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.711e-6■■■■□ 22.7
GNL3Q9BVP2 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 22.2
GNL3Q9BVP2 ACAT2-202ENST00000467951 856 ntTSL 319.38■□□□□ 0.694e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.364e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 ZMYND8-208ENST00000435836 670 ntTSL 510.4□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.164e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 ZMYND8-210ENST00000446894 341 ntTSL 27.59□□□□□ -1.194e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 30.23□□□□□ -2.374e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC9.25□□□□□ -0.933e-14■■■■□ 19.7
GNL3Q9BVP2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.594e-82■■■■□ 19.7
GNL3Q9BVP2 LOXL1-203ENST00000566011 2786 ntTSL 522.72■■□□□ 1.234e-82■■■■□ 19.7
GNL3Q9BVP2 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 527.88■■■□□ 2.054e-8■■■■□ 19.6
Retrieved 100 of 598 protein–RNA pairs in 22.5 ms