Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVP2

GNL3, Guanine nucleotide-binding protein-like 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNL3Q9BVP2 CPSF1-205ENST00000531042 580 ntTSL 518.91■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 C17orf99-205ENST00000586999 379 ntTSL 217.22■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 C17orf99-206ENST00000591995 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.78■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 C17orf99-201ENST00000340363 984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 HDGFL3-204ENST00000563790 934 ntTSL 312.7□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 210.6□□□□□ -0.714e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 HDGFL3-206ENST00000568294 3397 ntTSL 410.28□□□□□ -0.764e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 GABRE-207ENST00000476016 813 ntTSL 49.58□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.964e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 UGP2-220ENST00000487640 566 ntTSL 48.9□□□□□ -0.984e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 HDGFL3-202ENST00000562702 449 ntTSL 58.03□□□□□ -1.124e-6■■■■■ 36.3
GNL3Q9BVP2 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.258e-11■■■■■ 35.5
GNL3Q9BVP2 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.025e-56■■■■■ 35.3
GNL3Q9BVP2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 34.3
GNL3Q9BVP2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.523e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.413e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.333e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-210ENST00000519569 2355 ntTSL 222.38■■□□□ 1.173e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-215ENST00000520266 878 ntTSL 322.33■■□□□ 1.173e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-219ENST00000521766 2736 ntTSL 222.26■■□□□ 1.153e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.123e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.943e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-229ENST00000523485 2705 ntTSL 220.26■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-207ENST00000518686 2897 ntTSL 218.61■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-238ENST00000559838 643 ntTSL 315.47■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-236ENST00000559138 2041 ntTSL 1 (best)14.67□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-240ENST00000562292 735 ntTSL 512.94□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-235ENST00000557823 635 ntTSL 312.57□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-217ENST00000521388 770 ntTSL 511.65□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MOK-231ENST00000524120 546 ntTSL 311.06□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 33.8
GNL3Q9BVP2 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC6.59□□□□□ -1.351e-323■■■■■ 33.6
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 318.98■□□□□ 0.631e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.461e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.081e-323■■■■■ 33.4
GNL3Q9BVP2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.922e-8■■■■■ 32.6
GNL3Q9BVP2 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)19.92■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 32.6
GNL3Q9BVP2 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 32.6
GNL3Q9BVP2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.952e-10■■■■■ 31.7
GNL3Q9BVP2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.172e-10■■■■■ 31.7
GNL3Q9BVP2 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 410.52□□□□□ -0.732e-10■■■■■ 31.7
GNL3Q9BVP2 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.114e-13■■■■■ 29.6
GNL3Q9BVP2 ZFHX4-AS1-204ENST00000522961 240 ntTSL 514.13□□□□□ -0.154e-13■■■■■ 29.6
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.585e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.115e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-205ENST00000462715 2428 ntTSL 212.75□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 TRAPPC3-206ENST00000469757 221 ntTSL 29.89□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 29.2
GNL3Q9BVP2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.211e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 OPA1-214ENST00000482865 567 ntTSL 47.37□□□□□ -1.231e-24■■■■■ 28.5
GNL3Q9BVP2 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 27.6
GNL3Q9BVP2 CPM-213ENST00000551897 655 ntTSL 512.17□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 27.6
GNL3Q9BVP2 CPM-203ENST00000546556 697 ntTSL 211.26□□□□□ -0.613e-9■■■■■ 27.6
GNL3Q9BVP2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.545e-25■■■■■ 27.4
GNL3Q9BVP2 MSMO1-205ENST00000507013 973 ntTSL 225.63■■□□□ 1.695e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-213ENST00000440349 1509 ntTSL 1 (best)22.25■■□□□ 1.155e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.665e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.175e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-218ENST00000495516 350 ntTSL 515.28■□□□□ 0.045e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-212ENST00000412402 3495 ntTSL 213.6□□□□□ -0.235e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.055e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 MSMO1-204ENST00000505270 482 ntTSL 37.71□□□□□ -1.185e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.365e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.535e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 FOXP2-214ENST00000441290 8301 ntTSL 24□□□□□ -1.775e-8■■■■□ 26.2
GNL3Q9BVP2 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.54□□□□□ -21e-323■■■■□ 26.1
GNL3Q9BVP2 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.85□□□□□ -1.794e-8■■■■□ 24.4
GNL3Q9BVP2 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-323■■■■□ 24.2
GNL3Q9BVP2 AKAP6-202ENST00000553547 2274 ntTSL 211.05□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 22.7
GNL3Q9BVP2 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.161e-6■■■■□ 22.7
GNL3Q9BVP2 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 22.7
GNL3Q9BVP2 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.711e-6■■■■□ 22.7
GNL3Q9BVP2 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 22.2
GNL3Q9BVP2 ACAT2-202ENST00000467951 856 ntTSL 319.38■□□□□ 0.694e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.364e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 ZMYND8-208ENST00000435836 670 ntTSL 510.4□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.164e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 ZMYND8-210ENST00000446894 341 ntTSL 27.59□□□□□ -1.194e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 30.23□□□□□ -2.374e-6■■■■□ 20.2
GNL3Q9BVP2 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC9.25□□□□□ -0.933e-14■■■■□ 19.7
GNL3Q9BVP2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.594e-82■■■■□ 19.7
GNL3Q9BVP2 LOXL1-203ENST00000566011 2786 ntTSL 522.72■■□□□ 1.234e-82■■■■□ 19.7
GNL3Q9BVP2 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 527.88■■■□□ 2.054e-8■■■■□ 19.6
Retrieved 100 of 598 protein–RNA pairs in 23.4 ms