RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.93■■■□□ 2.86
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TRAPPC3-201ENST00000373159 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3-201ENST00000373159 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 NACADO15069 1562 aa28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3-201ENST00000373159 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC3-201ENST00000373159 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.64■■■□□ 2.02
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TRAPPC3-201ENST00000373159 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
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TRAPPC3-201ENST00000373159 SCRIBQ14160 1630 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3-201ENST00000373159 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3-201ENST00000373159 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3-201ENST00000373159 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3-201ENST00000373159 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3-201ENST00000373159 NCAPD3P42695 1498 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3-201ENST00000373159 CUX2O14529 1486 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMARCA2P51531 1590 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 ERCC6Q03468 1493 aa25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMARCA4P51532 1647 aa25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 HMGXB3Q12766 1538 aa25.64■■□□□ 1.7
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TRAPPC3-201ENST00000373159 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC3-201ENST00000373159 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3-201ENST00000373159 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3-201ENST00000373159 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3-201ENST00000373159 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-201ENST00000373159 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.05■■□□□ 1.6
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TRAPPC3-201ENST00000373159 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 WDR62O43379 1518 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3-201ENST00000373159 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-201ENST00000373159 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3-201ENST00000373159 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3-201ENST00000373159 CFTRP13569 1480 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3-201ENST00000373159 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRIM41Q8WV44 630 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3-201ENST00000373159 OSCARQ8IYS5 282 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3-201ENST00000373159 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3-201ENST00000373159 IFT140Q96RY7 1462 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRDM2Q13029 1718 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC3-201ENST00000373159 TOPBP1Q92547 1522 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC3-201ENST00000373159 ABCC8Q09428 1581 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC3-201ENST00000373159 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3-201ENST00000373159 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3-201ENST00000373159 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3-201ENST00000373159 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3-201ENST00000373159 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.456e-9■■■■■ 53.4
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TRAPPC3-201ENST00000373159 ARHGEF11O15085 1522 aa24.09■■□□□ 1.45
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TRAPPC3-201ENST00000373159 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3-201ENST00000373159 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3-201ENST00000373159 FBLN2P98095 1184 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC3-201ENST00000373159 SOGA1O94964 1423 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC3-201ENST00000373159 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3-201ENST00000373159 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3-201ENST00000373159 CHD1O14646 1710 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC3-201ENST00000373159 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARAP1Q96P48 1450 aa23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3-201ENST00000373159 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3-201ENST00000373159 WDR97A6NE52 1622 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3-201ENST00000373159 CUX1P39880 1505 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3-201ENST00000373159 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3-201ENST00000373159 GRIN2BQ13224 1484 aa23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3-201ENST00000373159 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC3-201ENST00000373159 SYNJ2O15056 1496 aa23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC3-201ENST00000373159 SYNJ1O43426 1573 aa23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC3-201ENST00000373159 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC3-201ENST00000373159 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3-201ENST00000373159 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-201ENST00000373159 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-201ENST00000373159 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.51■■□□□ 1.35
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TRAPPC3-201ENST00000373159 NUP160Q12769 1436 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-201ENST00000373159 TOP2BQ02880 1626 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 ADAMTS12P58397 1594 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 CEP170Q5SW79 1584 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 JPH4Q96JJ6 628 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 SHROOM2Q13796 1616 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGF1RP08069 1367 aa23.07■■□□□ 1.28
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