RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC3-206ENST00000469757 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC3-206ENST00000469757 NACADO15069 1562 aa17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC3-206ENST00000469757 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.04■□□□□ 0.32
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TRAPPC3-206ENST00000469757 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.97■□□□□ 0.15
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TRAPPC3-206ENST00000469757 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
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TRAPPC3-206ENST00000469757 TOPBP1Q92547 1522 aa14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC3-206ENST00000469757 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.7□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-206ENST00000469757 TOP2BQ02880 1626 aa14.67□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-206ENST00000469757 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-206ENST00000469757 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-206ENST00000469757 SOGA1O94964 1423 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-206ENST00000469757 PBRM1Q86U86 1689 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-206ENST00000469757 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 40.7
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TRAPPC3-206ENST00000469757 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHD1O14646 1710 aa14.42□□□□□ -0.1
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TRAPPC3-206ENST00000469757 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.41□□□□□ -0.1
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TRAPPC3-206ENST00000469757 OSCARQ8IYS5 282 aa14.26□□□□□ -0.13
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TRAPPC3-206ENST00000469757 CEP170Q5SW79 1584 aa14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGF1RP08069 1367 aa14.21□□□□□ -0.14
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SHROOM2Q13796 1616 aa14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARHGEF11O15085 1522 aa14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC3-206ENST00000469757 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC3-206ENST00000469757 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC3-206ENST00000469757 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC3-206ENST00000469757 FBLN2P98095 1184 aa14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRIM41Q8WV44 630 aa14.14□□□□□ -0.15
TRAPPC3-206ENST00000469757 EEA1Q15075 1411 aa14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRXQ9BXM0 1461 aa14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC3-206ENST00000469757 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC3-206ENST00000469757 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.09□□□□□ -0.15
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