RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444719.5

LMBR1-211, Transcript of limb development membrane protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene LMBR1, Length 762 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1-211ENST00000444719 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.68■■■■■ 6.34
LMBR1-211ENST00000444719 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.74■■■■■ 5.39
LMBR1-211ENST00000444719 ABCC9O60706 1549 aa48.17■■■■■ 5.3
LMBR1-211ENST00000444719 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.08■■■■■ 4.97
LMBR1-211ENST00000444719 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.04■■■■■ 4.96
LMBR1-211ENST00000444719 NACADO15069 1562 aa45.91■■■■■ 4.94
LMBR1-211ENST00000444719 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
LMBR1-211ENST00000444719 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.42■■■■■ 4.86
LMBR1-211ENST00000444719 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.15■■■■■ 4.82
LMBR1-211ENST00000444719 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.12■■■■■ 4.81
LMBR1-211ENST00000444719 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.99■■■■■ 4.79
LMBR1-211ENST00000444719 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.73■■■■■ 4.75
LMBR1-211ENST00000444719 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.57■■■■■ 4.73
LMBR1-211ENST00000444719 SCRIBQ14160 1630 aa44.57■■■■■ 4.72
LMBR1-211ENST00000444719 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.05■■■■■ 4.64
LMBR1-211ENST00000444719 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
LMBR1-211ENST00000444719 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.52■■■■■ 4.56
LMBR1-211ENST00000444719 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.26■■■■■ 4.52
LMBR1-211ENST00000444719 SMARCA4P51532 1647 aa42.53■■■■■ 4.4
LMBR1-211ENST00000444719 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
LMBR1-211ENST00000444719 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.36■■■■■ 4.37
LMBR1-211ENST00000444719 NCAPD3P42695 1498 aa42.36■■■■■ 4.37
LMBR1-211ENST00000444719 SMARCA2P51531 1590 aa42.27■■■■■ 4.36
LMBR1-211ENST00000444719 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.18■■■■■ 4.34
LMBR1-211ENST00000444719 HMGXB3Q12766 1538 aa42.1■■■■■ 4.33
LMBR1-211ENST00000444719 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.03■■■■■ 4.32
LMBR1-211ENST00000444719 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
LMBR1-211ENST00000444719 WIZO95785 1651 aa41.76■■■■■ 4.28
LMBR1-211ENST00000444719 NESP48681 1621 aa41.58■■■■■ 4.25
LMBR1-211ENST00000444719 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
LMBR1-211ENST00000444719 ERCC6Q03468 1493 aa41.52■■■■■ 4.24
LMBR1-211ENST00000444719 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.33■■■■■ 4.21
LMBR1-211ENST00000444719 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
LMBR1-211ENST00000444719 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.14■■■■■ 4.18
LMBR1-211ENST00000444719 CUX2O14529 1486 aa41.11■■■■■ 4.17
LMBR1-211ENST00000444719 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.09■■■■■ 4.17
LMBR1-211ENST00000444719 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.06■■■■■ 4.16
LMBR1-211ENST00000444719 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
LMBR1-211ENST00000444719 CFTRP13569 1480 aa40.8■■■■■ 4.12
LMBR1-211ENST00000444719 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.76■■■■■ 4.12
LMBR1-211ENST00000444719 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.7■■■■■ 4.11
LMBR1-211ENST00000444719 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.67■■■■■ 4.1
LMBR1-211ENST00000444719 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.67■■■■■ 4.1
LMBR1-211ENST00000444719 PRDM2Q13029 1718 aa40.53■■■■■ 4.08
LMBR1-211ENST00000444719 WDR62O43379 1518 aa40.52■■■■■ 4.08
LMBR1-211ENST00000444719 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
LMBR1-211ENST00000444719 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.36■■■■■ 4.05
LMBR1-211ENST00000444719 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
LMBR1-211ENST00000444719 TOPBP1Q92547 1522 aa40.01■■■■□ 3.99
LMBR1-211ENST00000444719 ABCC8Q09428 1581 aa39.92■■■■□ 3.98
LMBR1-211ENST00000444719 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.9■■■■□ 3.98
LMBR1-211ENST00000444719 IFT140Q96RY7 1462 aa39.81■■■■□ 3.96
LMBR1-211ENST00000444719 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
LMBR1-211ENST00000444719 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.94
LMBR1-211ENST00000444719 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
LMBR1-211ENST00000444719 CUX1P39880 1505 aa39.59■■■■□ 3.93
LMBR1-211ENST00000444719 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.53■■■■□ 3.92
LMBR1-211ENST00000444719 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
LMBR1-211ENST00000444719 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.5■■■■□ 3.91
LMBR1-211ENST00000444719 SOGA1O94964 1423 aa39.49■■■■□ 3.91
LMBR1-211ENST00000444719 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.47■■■■□ 3.915e-8■■■■■ 27.4
LMBR1-211ENST00000444719 OSCARQ8IYS5 282 aa39.44■■■■□ 3.9
LMBR1-211ENST00000444719 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
LMBR1-211ENST00000444719 WDR97A6NE52 1622 aa39.18■■■■□ 3.86
LMBR1-211ENST00000444719 CHD1O14646 1710 aa39.17■■■■□ 3.86
LMBR1-211ENST00000444719 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.17■■■■□ 3.862e-6■■■■■ 59.6
LMBR1-211ENST00000444719 FBLN2P98095 1184 aa39.14■■■■□ 3.86
LMBR1-211ENST00000444719 SYNJ1O43426 1573 aa39.13■■■■□ 3.85
LMBR1-211ENST00000444719 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.13■■■■□ 3.85
LMBR1-211ENST00000444719 TOP2BQ02880 1626 aa39.12■■■■□ 3.85
LMBR1-211ENST00000444719 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.07■■■■□ 3.85
LMBR1-211ENST00000444719 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.05■■■■□ 3.84
LMBR1-211ENST00000444719 GRIN2BQ13224 1484 aa39.03■■■■□ 3.84
LMBR1-211ENST00000444719 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.02■■■■□ 3.84
LMBR1-211ENST00000444719 PBRM1Q86U86 1689 aa39■■■■□ 3.83
LMBR1-211ENST00000444719 TRIM41Q8WV44 630 aa39■■■■□ 3.83
LMBR1-211ENST00000444719 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.95■■■■□ 3.83
LMBR1-211ENST00000444719 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
LMBR1-211ENST00000444719 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
LMBR1-211ENST00000444719 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.86■■■■□ 3.81
LMBR1-211ENST00000444719 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.86■■■■□ 3.81
LMBR1-211ENST00000444719 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.86■■■■□ 3.81
LMBR1-211ENST00000444719 SYNJ2O15056 1496 aa38.81■■■■□ 3.8
LMBR1-211ENST00000444719 ARHGEF11O15085 1522 aa38.77■■■■□ 3.8
LMBR1-211ENST00000444719 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.63■■■■□ 3.78
LMBR1-211ENST00000444719 ADAMTS12P58397 1594 aa38.61■■■■□ 3.77
LMBR1-211ENST00000444719 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.58■■■■□ 3.77
LMBR1-211ENST00000444719 GRIN2AQ12879 1464 aa38.54■■■■□ 3.76
LMBR1-211ENST00000444719 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.53■■■■□ 3.76
LMBR1-211ENST00000444719 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.52■■■■□ 3.76
LMBR1-211ENST00000444719 ARAP1Q96P48 1450 aa38.44■■■■□ 3.74
LMBR1-211ENST00000444719 CEP170Q5SW79 1584 aa38.4■■■■□ 3.74
LMBR1-211ENST00000444719 KIF27Q86VH2 1401 aa38.38■■■■□ 3.73
LMBR1-211ENST00000444719 NUP160Q12769 1436 aa38.35■■■■□ 3.73
LMBR1-211ENST00000444719 IGF1RP08069 1367 aa38.29■■■■□ 3.72
LMBR1-211ENST00000444719 CUL7Q14999 1698 aa38.18■■■■□ 3.7
LMBR1-211ENST00000444719 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.17■■■■□ 3.7
LMBR1-211ENST00000444719 SHROOM2Q13796 1616 aa38.12■■■■□ 3.69
LMBR1-211ENST00000444719 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.06■■■■□ 3.68
LMBR1-211ENST00000444719 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.04■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms