Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD20A3Q5VUR7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD20A3Q5VUR7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms