Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms