RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540235.5

KRT17-205, Transcript of keratin 17, human

TSL 5 BASIC

Gene KRT17, Length 1,438 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRT17-205	ENST00000540235	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.59	■■■■■ 4.89
KRT17-205	ENST00000540235	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.29	■■■■■ 4.04
KRT17-205	ENST00000540235	ABCC9	O60706	1549 aa		39.07	■■■■□ 3.85
KRT17-205	ENST00000540235	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.05	■■■■□ 3.68
KRT17-205	ENST00000540235	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.92	■■■■□ 3.66
KRT17-205	ENST00000540235	NACAD	O15069	1562 aa		37.81	■■■■□ 3.64
KRT17-205	ENST00000540235	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.74	■■■■□ 3.63
KRT17-205	ENST00000540235	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.73	■■■■□ 3.63
KRT17-205	ENST00000540235	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.73	■■■■□ 3.63
KRT17-205	ENST00000540235	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.93	■■■■□ 3.5
KRT17-205	ENST00000540235	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.82	■■■■□ 3.49
KRT17-205	ENST00000540235	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.64	■■■■□ 3.46
KRT17-205	ENST00000540235	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.62	■■■■□ 3.45
KRT17-205	ENST00000540235	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.27	■■■■□ 3.4
KRT17-205	ENST00000540235	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.61	■■■■□ 3.29
KRT17-205	ENST00000540235	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.58	■■■■□ 3.29
KRT17-205	ENST00000540235	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.51	■■■■□ 3.27
KRT17-205	ENST00000540235	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.36	■■■■□ 3.25
KRT17-205	ENST00000540235	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.27	■■■■□ 3.24
KRT17-205	ENST00000540235	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.26	■■■■□ 3.24
KRT17-205	ENST00000540235	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.17	■■■■□ 3.22
KRT17-205	ENST00000540235	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35	■■■■□ 3.19
KRT17-205	ENST00000540235	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.93	■■■■□ 3.18
KRT17-205	ENST00000540235	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.93	■■■■□ 3.18
KRT17-205	ENST00000540235	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.92	■■■■□ 3.18
KRT17-205	ENST00000540235	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.92	■■■■□ 3.18
KRT17-205	ENST00000540235	WIZ	O95785	1651 aa		34.8	■■■■□ 3.16
KRT17-205	ENST00000540235	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.74	■■■■□ 3.15
KRT17-205	ENST00000540235	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.69	■■■■□ 3.14
KRT17-205	ENST00000540235	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.41	■■■■□ 3.1
KRT17-205	ENST00000540235	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	34.33	■■■■□ 3.09
KRT17-205	ENST00000540235	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.05	■■■■□ 3.04
KRT17-205	ENST00000540235	NES	P48681	1621 aa		33.96	■■■■□ 3.03
KRT17-205	ENST00000540235	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.93	■■■■□ 3.02
KRT17-205	ENST00000540235	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.89	■■■■□ 3.02
KRT17-205	ENST00000540235	CFTR	P13569	1480 aa		33.81	■■■■□ 3
KRT17-205	ENST00000540235	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.66	■■■□□ 2.98
KRT17-205	ENST00000540235	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.6	■■■□□ 2.97
KRT17-205	ENST00000540235	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.53	■■■□□ 2.96
KRT17-205	ENST00000540235	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.52	■■■□□ 2.96
KRT17-205	ENST00000540235	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.51	■■■□□ 2.96
KRT17-205	ENST00000540235	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.4	■■■□□ 2.94
KRT17-205	ENST00000540235	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
KRT17-205	ENST00000540235	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.27	■■■□□ 2.92
KRT17-205	ENST00000540235	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
KRT17-205	ENST00000540235	WDR62	O43379	1518 aa		33.16	■■■□□ 2.9
KRT17-205	ENST00000540235	CUX2	O14529	1486 aa		33.11	■■■□□ 2.89
KRT17-205	ENST00000540235	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.03	■■■□□ 2.88
KRT17-205	ENST00000540235	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.02	■■■□□ 2.88
KRT17-205	ENST00000540235	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33	■■■□□ 2.87
KRT17-205	ENST00000540235	CUX1	P39880	1505 aa		32.95	■■■□□ 2.87
KRT17-205	ENST00000540235	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.88	■■■□□ 2.85
KRT17-205	ENST00000540235	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.78	■■■□□ 2.84
KRT17-205	ENST00000540235	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
KRT17-205	ENST00000540235	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.76	■■■□□ 2.83
KRT17-205	ENST00000540235	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.75	■■■□□ 2.83
KRT17-205	ENST00000540235	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.74	■■■□□ 2.83
KRT17-205	ENST00000540235	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.7	■■■□□ 2.83
KRT17-205	ENST00000540235	SOGA1	O94964	1423 aa		32.65	■■■□□ 2.82
KRT17-205	ENST00000540235	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.65	■■■□□ 2.82
KRT17-205	ENST00000540235	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
KRT17-205	ENST00000540235	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
KRT17-205	ENST00000540235	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.47	■■■□□ 2.79
KRT17-205	ENST00000540235	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.45	■■■□□ 2.78
KRT17-205	ENST00000540235	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
KRT17-205	ENST00000540235	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.43	■■■□□ 2.78
KRT17-205	ENST00000540235	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
KRT17-205	ENST00000540235	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.4	■■■□□ 2.78
KRT17-205	ENST00000540235	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.33	■■■□□ 2.77
KRT17-205	ENST00000540235	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.29	■■■□□ 2.76
KRT17-205	ENST00000540235	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.27	■■■□□ 2.76
KRT17-205	ENST00000540235	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.21	■■■□□ 2.75
KRT17-205	ENST00000540235	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.15	■■■□□ 2.74
KRT17-205	ENST00000540235	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.14	■■■□□ 2.74
KRT17-205	ENST00000540235	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.1	■■■□□ 2.73
KRT17-205	ENST00000540235	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.07	■■■□□ 2.72
KRT17-205	ENST00000540235	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
KRT17-205	ENST00000540235	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.05	■■■□□ 2.72
KRT17-205	ENST00000540235	IGF1R	P08069	1367 aa		32.03	■■■□□ 2.72
KRT17-205	ENST00000540235	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.95	■■■□□ 2.71
KRT17-205	ENST00000540235	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.93	■■■□□ 2.7
KRT17-205	ENST00000540235	FBLN2	P98095	1184 aa		31.92	■■■□□ 2.7
KRT17-205	ENST00000540235	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.92	■■■□□ 2.7
KRT17-205	ENST00000540235	CHD1	O14646	1710 aa		31.92	■■■□□ 2.7
KRT17-205	ENST00000540235	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
KRT17-205	ENST00000540235	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.86	■■■□□ 2.69
KRT17-205	ENST00000540235	CUL7	Q14999	1698 aa		31.83	■■■□□ 2.69
KRT17-205	ENST00000540235	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		31.81	■■■□□ 2.68
KRT17-205	ENST00000540235	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.8	■■■□□ 2.68
KRT17-205	ENST00000540235	EEA1	Q15075	1411 aa		31.79	■■■□□ 2.68
KRT17-205	ENST00000540235	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		31.75	■■■□□ 2.67
KRT17-205	ENST00000540235	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
KRT17-205	ENST00000540235	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.67	■■■□□ 2.66
KRT17-205	ENST00000540235	PRX	Q9BXM0	1461 aa		31.67	■■■□□ 2.66
KRT17-205	ENST00000540235	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		31.66	■■■□□ 2.66
KRT17-205	ENST00000540235	NUP160	Q12769	1436 aa		31.65	■■■□□ 2.66
KRT17-205	ENST00000540235	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.63	■■■□□ 2.65
KRT17-205	ENST00000540235	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.6	■■■□□ 2.65
KRT17-205	ENST00000540235	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		31.45	■■■□□ 2.62
KRT17-205	ENST00000540235	KIF21B	O75037	1637 aa		31.44	■■■□□ 2.62

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