Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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