Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIF1AQ16665 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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