Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC24CP53992 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.6 ms