Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
J3KRW8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
J3KRW8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
J3KRW8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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