Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HIF1AQ16665 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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