Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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EXT1Q16394 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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EXT1Q16394 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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EXT1Q16394 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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EXT1Q16394 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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EXT1Q16394 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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EXT1Q16394 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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EXT1Q16394 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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EXT1Q16394 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EXT1Q16394 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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