Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HIF1AQ16665 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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