Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCSO14618 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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