Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms