Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CGGBP1Q9UFW8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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