Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms