Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms