Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF6Q9Y252 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF6Q9Y252 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF6Q9Y252 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms