Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM9

B9D1, B9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B9D1Q9UPM9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B9D1Q9UPM9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B9D1Q9UPM9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B9D1Q9UPM9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B9D1Q9UPM9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B9D1Q9UPM9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B9D1Q9UPM9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B9D1Q9UPM9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms