Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCTPQ9UKL6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCTPQ9UKL6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCTPQ9UKL6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCTPQ9UKL6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCTPQ9UKL6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCTPQ9UKL6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCTPQ9UKL6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCTPQ9UKL6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCTPQ9UKL6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCTPQ9UKL6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCTPQ9UKL6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCTPQ9UKL6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms