Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF2Q9NX18 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SDHAF2Q9NX18 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDHAF2Q9NX18 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SDHAF2Q9NX18 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms