Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBNL3Q9NUK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBNL3Q9NUK0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MBNL3Q9NUK0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBNL3Q9NUK0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms