Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2J2Q9GZM3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2J2Q9GZM3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2J2Q9GZM3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms