Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRINP2Q9C0B6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRINP2Q9C0B6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRINP2Q9C0B6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP2Q9C0B6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms