Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PYM1Q9BRP8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PYM1Q9BRP8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PYM1Q9BRP8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PYM1Q9BRP8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms