Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DUSP9Q99956 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
DUSP9Q99956 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
DUSP9Q99956 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUSP9Q99956 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUSP9Q99956 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUSP9Q99956 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms