Protein–RNA interactions for Protein: Q99705

MCHR1, Melanin-concentrating hormone receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCHR1Q99705 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCHR1Q99705 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCHR1Q99705 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCHR1Q99705 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCHR1Q99705 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCHR1Q99705 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms