Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMS19Q96T76 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMS19Q96T76 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMS19Q96T76 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MMS19Q96T76 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MMS19Q96T76 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMS19Q96T76 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMS19Q96T76 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMS19Q96T76 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MMS19Q96T76 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMS19Q96T76 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMS19Q96T76 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMS19Q96T76 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMS19Q96T76 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MMS19Q96T76 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMS19Q96T76 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMS19Q96T76 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MMS19Q96T76 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMS19Q96T76 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMS19Q96T76 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MMS19Q96T76 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms