Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CDCA7LQ96GN5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CDCA7LQ96GN5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CDCA7LQ96GN5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDCA7LQ96GN5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDCA7LQ96GN5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDCA7LQ96GN5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDCA7LQ96GN5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms