Protein–RNA interactions for Protein: Q96G23

CERS2, Ceramide synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2Q96G23 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CERS2Q96G23 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CERS2Q96G23 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CERS2Q96G23 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CERS2Q96G23 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CERS2Q96G23 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CERS2Q96G23 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms