Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTP4Q96DX8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP4Q96DX8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP4Q96DX8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms