Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C12orf43Q96C57 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf43Q96C57 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C12orf43Q96C57 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms