Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX4Q969G2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX4Q969G2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms