Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RUBCNQ92622 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUBCNQ92622 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUBCNQ92622 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms