Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVBPQ8N300 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SVBPQ8N300 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms