Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYJ3

SYTL1, Synaptotagmin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYTL1Q8IYJ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYTL1Q8IYJ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYTL1Q8IYJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYTL1Q8IYJ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYTL1Q8IYJ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYTL1Q8IYJ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL1Q8IYJ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYTL1Q8IYJ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYTL1Q8IYJ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYTL1Q8IYJ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYTL1Q8IYJ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms