Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR88Q6ZMY6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR88Q6ZMY6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR88Q6ZMY6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms