Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRIP3Q6Q6R5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRIP3Q6Q6R5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRIP3Q6Q6R5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRIP3Q6Q6R5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms